در خصوص مذهب هخامنشیان نظر یکسانی وجود ندارد. بعضی از محققان آنان را زرتشتی می‌دانند؛ در حالی که هخامنشیان فقط در برخی موارد با مذهب زرتشتی اشتراک‌هایی داشته‌اند.
اما این اشتراک‌ها لزوماً نمی‌تواند به معنی زرتشتی بودن آنها باشد
چرا که میان عملکرد هخامنشیان و باورهای زرتشتی تفاوت‌های جدی وجود دارد.
به عنوان مثال، هخامنشیان مردگان خود را دفن می‌کردند و شاهان هخامنشی همگی مقبره دارند
اما در آیین زرتشت دفن اجساد انسان‌ها جایز نیست. زیرا آلوده کردن زمین را گناه می‌دانستند.
زرتشت مردم را از قربانی کردن حیوانات در مراسم مذهبی منع کرده بود؛ در حالی که هخامنشیان گاو و گوسفند را قربانی می‌کردند.
نکته دیگر که در زرتشتی بودن هخامنشیان تردید جدی ایجاد می کند، این است که در نوشته‌ها و کتیبه‌های هخامنشی، نامی از زرتشت نمی‌بینیم
چگونه می‌توان قبول کرد که قومی پیرو آیین و مذهبی باشند؛ ولی در نوشته‌های خود نامی از پیامبرشان نبردند!؟
برای مطالعه بیشتر بنگرید به: تاریخ فرهنگ و تمدن ایران در دوره هخامنشیان، عباس قدیانی، ص ۲۰۱
